A fertőzést az újszülött megkaphatja intrauterin (transzplacentáris úton, kongenitálisan), konnatálisan (szülés közben), valamint posztnatálisan (születést követően). Számos kórokozó okozhat hasonló klinika tünetekkel és szövettani eltéréssel járó neonatalis hepatitist. Kongenitális hepatitist okoz a Trepomma pallidum, a Toxoplasma gondii, a Rubella és a Cytomegalovírus. Szülés közbeni direkt kontaktus útján alakulhat ki a neonatális Listeria, Herpes simplex, és CMV fertőzés. Postnatális fertőzés lényegesen ritkábban okoz neonatális hepatitist. A neonatális cholestasis egyéb ok miatt kialakult betegségeiben (biliaris atresia, choledochus cysta, nem kezelhető anyagcsere-betegség) a prognózis rosszabb. A neonatális hepatitis prognózisa jobb, a gyógyulási arány 60-80%.