Hasmenést a gastrointestinalis rendszert érintő különböző patológiai folyamatok idézhetnek elő. Az infekt gastroenteritisek világszerte a morbiditás, illetve a mortalitás második leggyakoribb okát képezik. A fejlett országokban a munkából való kiesés, míg a fejlődő országokban a halálozás vezető okai. Évente 5-10 millió ember halálát okozzák. A sokféle etiológiai ágens által előidézett "utazók hasmenése" a fejlődő országokba utazók gyakori, rendszerint néhány napig tartó megbetegedése, az infekció azonban a posztinfekciós irritábilis bél szindróma kiváltásában is szerepet játszhat. Az infekt ágensek vagy az intestinalis mucosához történő adherenciájukkal, vagy a mucosa inváziójával, vagy enterotoxin, illetve enterotoxin/citotoxin képzéssel idézik elő a tüneteket. Akut infekt gastroenteritisekben az inkubációs idő alapján következtethetünk az etiológiára. Ha a lappangási idő 6 órán belüli, S. aureus - vagy B. cereus - toxin idézi elő a tüneteket. Újabban hipervirulens C. difficile-törzsek okoznak járványokat. Néhány patogén ágens krónikus hasmenés okozója lehet, leggyakrabban C. difficile-, Giardia lamblia-, Entamoeba histolytica-, Cryptosporidium-, Aeromonas- és Yersinia- fertőzés kapcsán alakul ki. A protozoonok által közvetített megbetegedések közül az amoebiasis a malária után világszerte a második leggyakoribb, halálhoz vezető betegség. A krónikus hasmenés oka lehet a HIV-fertőzés is.