A Clostridium difficile fertőzés az antibiotikus kezelés következtében kialakuló hasmenéses esetek (AAD) 15-25%-áért felelős. A C. difficile fontos nozokomiális kórokozó, az antibiotikus kezelés és a kórházi ápolás növeli a fertőzés kockázatát. Az egészséges bélflóra összetételének megváltozása, a kórokozó által termelt toxinok, a gyengült immunrendszer egyaránt fontos szerepet játszanak a fertőzés kialakulásában. A klinikai kép az enyhe hasmenéstől a súlyos colitisig változatos lehet. Az elmúlt évtizedekben a C. difficile fertőzés gyakoriságának és a kórokozó virulenciájának növekedését figyelték meg. Az Egyesült Államokban, Kanadában és az Egyesült Királyságban egy korábban ritkának tartott baktériumtörzs (NAP-11027) okozott járványszerű betegséget. A NAP-11027 törzs nagy mennyiségben termel toxin A-t és B-t, illetve egy ún. bináris toxint, a fertőzés a hagyományos törzseknél nagyobb mortalitással jár és kevésbé reagál az antibiotikus kezelésre. A kezelés alapját továbbra is metronidazol vagy vancomycin adása képezi. Probiotikumok, intravénás immunglobulin és rifampin adása jó hatású lehet rekurrens fertőzésben, de kontrollált tanulmányok jelenleg nem állnak rendelkezésre.