A mucosalis szövetek legfontosabb feladata, hogy hatékony barriert képezzenek a kórokozók és a makromolekulák ellen úgy, hogy ezzel egy időben megfelelő permeabilitást biztosítsanak a felszívódás számára. A mucosalis védővonal egymásra épülő szerkezeti elemei az epithelium szorosan zárt columnalis sejtjei, a glycocalix, a sejtfelszíni nyák, amely szekretoros IgA-molekulákat tartalmaz. A mucosa-asszociált lymphoid szövet képezi a következő barriert, amely a potenciálisan veszélyes antigéneket távol tartja a keringéstől. A különböző nyálkahártyafelszínek lymphoid rendszerei, annak ellenére, hogy számos morfológiai és funkcionális hasonlóságot mutatnak, mégsem egyforma felépítésűek és működésűek. Ugyanakkor az egyes mucosalis lymphoid struktúrák funkciói egymással mégis összekapcsolódnak, ezért manapság az integrált mucosalis immunrendszer (CMIS = common mucosal immune system) kifejezés használata célszerű. Ennek elemei a gastrointestinalis (GALT), a bronchialis (BALT), a nazális (NALT) és a laryngealis (LALT) mucosa immunrendszerei.